Départ vendredi 6h. Pas de montée au Puy de Dôme à cause des conditions météo (🥶🌧️⛈️). Espérons le voir tout de même à travers les nuages !

Do you work with genetic resources collected elsewhere 🧬 ? Are you confident that you’re using them fairly and legally? New step-by-step guide to the Nagoya Protocol helps researchers navigate this complex framework. www.ebi.ac.uk/about/news/p...

For more information and to pre-register: training.galaxyproject.org/training-mat... @galaxyproject.bsky.social @galaxytraining.bsky.social

I'm thrilled to co-organize and teach at the first-ever training event focused on advanced Galaxy features: workflows, API, and more! Registration is now open until June 5, so don’t miss your chance to dive deep into these powerful tools.

Le BSI, l'autorité allemande de cybersécurité, s'inquiète de la capacité de Mythos d'Anthropic, à accélérer massivement la découverte de failles logicielles. 👉 www.latribune.fr/art...

Excited to discover that two of my software tools (Shovill & Snippy) were used to assemble the genome of the #Hantavirus Andes Chile-9717869 strain. #bioinforbioinformatics #genomics #microbiology www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MT95...

🧵 THREAD: Hantavirus on a cruise ship What we know, What investigators are doing, and Why you don't need to panic

🎊 Félicitations à Sophie Schbath, nommée #ISCB #Fellow 2026 ! 👏 Présidente de la SFBI (2011-2015), Sophie a contribué à notre communauté par son dynamisme scientifique et humain. Merci à @iscb.bsky.social pour cette distinction qui honore un membre de notre si belle communauté !

Congrats Sophie ! Well deserved , so proud for you !

A great meeting with a warm welcome from our spanish colleagues !

End-to-end evaluation of pipelines for metagenome-assembled genomes reveals hidden performance gaps https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.04.06.712906v1

La DINUM annonce le Socle Interministériel d'IA Générative, une offre mutualisée pour déployer l’IA générative dans les administrations françaises. 👉 alliance.numerique.g...

Whenever I presented Phold, I was frequently asked "can you do the same beyond phages?" We ( @oschwengers.bsky.social @linsalrob.bsky.social @binomicalabs.org et al) finally did it with Baktfold github.com/gbouras13/ba... www.biorxiv.org/content/10.6...

🧐 Baisse du nombre d'offres d'emploi (post-doctorants, ingénieurs, permanents ou temporaires) en 2025. 🫵 Besoin de vous pour comprendre les raisons de cette diminution via ce sondage : grist.numerique.gouv.fr/o/docs/forms... 📎 Bilan plus détaillé : www.sfbi.fr/blog/article...

[📢 #Workshop] Vous souhaitez en savoir plus sur la mise en conformité FAIR des données de métabarcoding ? 🗓️ Rendez-vous le 10 avril 2026 de 13h30 à 17h, pour un workshop en visio, organisé par le projet MUDIS4LS (www.ifb-elixir.fr/rd-innovatio...).

A lire, cet excellente histoire des rapports de l'État avec le logiciel libre et du projet La suite numérique : framablog.org/2026/03/19/l... merci @framasoft.org

✨ GCC2026 | Clermont-Ferrand, France 🇫🇷 The Galaxy Community Conference brings together researchers, developers, trainers, and users to share their work and ideas. 📣 Submit your abstract by April 6. galaxyproject.org/events/gcc20...

Check this out 👀 “Ten Common Misconceptions About Galaxy (And Why They Are Wrong!)” is now published in PLOS Computational Biology! The paper takes on 10 persistent myths about Galaxy and responds with evidence and real-world examples from the community. galaxyproject.org/news/2026-02...

We are pleased to announce the publication of panREPET, a pipeline that identifies TE insertions shared by groups of individuals. By Saidi, Blaison, del Pilar Rodríguez-Ordóñez, @johannconfais.bsky.social, @hquesneville.bsky.social 📖 doi.org/10.1186/s130...

🎉 Time to celebrate! The Galaxy Training Network just passed 500 tutorials! Free. Open. Community-built. Reproducible. Powered by 500+ contributors worldwide, making data analysis accessible to everyone. Be sure to check out this amazing team and the GTN, here: training.galaxyproject.org

Vous codez en R et souhaitez adopter le package #Tidyverse pour manipuler vos données de façon plus poussée ? 👉 Notre cycle de formation vous propose ce module de 2 jours à Jouy-en-Josas (78) 📅 30-31 mars 2026. 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous avez besoin de vous former à #Linux ? 👉 Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas 📅 1er avril 2026 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

📌 Enquête MERIT-SFBI sur les conditions de travail des bioinformaticien·ne·s dans les instituts de recherche, universités, établissements d’enseignement et recherche, secteur associatif ou privé 📎 framaforms.org/enquete-meri... ⏳ temps estimé : 20 minutes 📅 date limite de réponse : 31/03/2026

[LAST CALL] 📢🚨✍️ École thématique d’assemblage et annotation de génomes et métagénomes, organisée par l' @ifb-elixir-fr.bsky.social @inserm.fr @inrae-france.bsky.social Pré-inscriptions ouvertes jusqu’au 20 février !

🚨📢📄 Article in press in Genome Biology doi.org/10.1186/s130... We introduce panREPET, a reference-free pipeline to detect shared transposable element (TE) insertions across pangenomes and retrace their evolutionary dynamics #TEsky 🧵👇

Toujours le même constat et aucune action : « Le 2 février, 6 040 personnes qui étaient parvenues à joindre le 115 ont été laissées sans solution d’hébergement, soit 10 % de plus qu’à la même date en 2024. Parmi elles, 1 793 étaient des enfants – dont 390 âgés de moins de trois ans »

📌 #JOBIM2026 - Strasbourg (jobim2026.sfbi.fr) 📝 Appel à soumission jusqu’au 15/03. Infos : premc.org/doc/JOBIM202... 🏆 Prix meilleures talk et posters. Participation à la soumission de votre résumé 🚆👶 10 bourses de voyage ; demande du 30/04 au 21/05 + bourses garde d'enfant. Infos : www.sfbi.fr

Vous utilisez déjà Galaxy et souhaitez vous familiariser avec les méthodes et outils d’analyse bioinfo de données NGS ? #mapping #assemblage 👉Notre cycle de formation vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas (26 mars). 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous souhaitez vous initier aux bonnes pratiques pour la reproductibilité de vos analyses ? 👉 Nous vous proposons ce module d’un jour à Jouy-en-Josas (24 mars 2026). 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous pratiquez R et souhaitez créer votre 1e application web interactive à partir de scripts R ? #Shiny Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas (23 mars 2026). 📝 Inscription et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Marie Curie, Paulette Libermann, Sophie Germain… Les noms d’éminentes scientifiques seront gravés en lettres d’or, d’ici 2027, sur la tour Eiffel. L'astrophysicienne Isabelle Vauglin : «On travaille à pas de fourmis contre l’invisibilisation des femmes»

Besoin de vous former au langage R ? Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" propose ce module introductif à Jouy-en-Josas sur 2 jours (10 et 11 mars 2026). 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous pratiquez R mais souhaitez faire des graphiques sophistiqués avec le package #ggplot2 ? Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module d’un jour à Jouy-en-Josas (12 mars 2026). 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Besoin de manipuler vous-même votre jeu de données #RNAseq, depuis les étapes de bioinformatique à l’analyse différentielle, sans passer par la ligne de commande unix ? Ce module de 3 jours à Jouy (16-18 mars) est pour vous ! 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous souhaitez apprendre à annoter et comparer vous-même vos génomes bactériens ? Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module de 2 jours à Jouy-en-Josas (19-20 mars 2026). 📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Connexion directe de Galaxy à Recherche Data Gouv

🗜️⚡ If you use gzip/gunzip a lot in your pipelines, switch to the faster"libdeflate" versions instead! They use modern CPU capabilities to achieve a 2-3x speedup. libdeflate is in conda, and "libdeflate-gzip" and "libdeflate-gunzip" are drop-in replacements. #unix github.com/ebiggers/lib...

Notre cycle 2026 de formation "Bioinformatique par la pratique" est ouvert 🎉. 16 modules proposés de mars à juin, ouverts à tous ! 👉 Planning et inscriptions : documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Now published in Nature Biotechnology: go.nature.com/44P7nSm If you missed it, the TL;DR is in my April thread below

Face au froid, l’inaction n’est pas une option. 📞 Un réflexe citoyen si vous voyez une personne en détresse : appelez le 115. #GrandFroid #CroixRouge #Solidarité #UrgenceSociale

« Ne prendre en charge les femmes enceintes que si elles sont dans leur huitième mois de grossesse et ne prendre en charge que les familles avec des enfants [de]moins de trois mois » Face a la pénurie l’indigence des critères d’attribution de places au 115. www.franceinfo.fr/societe/pauv...

Save the date: The Galaxy Training Academy 2026 will happen from May 18th to May 22th Read more at https://training.galaxyproject.org/training-material/news/2025/11/13/gta-date-2026.html @galaxyproject.bsky.social

A Paris, le nombre de sans-abri dans les campements au plus haut depuis six ans

« Les salariés du 115 ont le sentiment d’être en première ligne face à un système grippé de l’intérieur » En Seine Saint-Denis comme ailleurs. Tellement de demandes, si peu de places ….

Gempipe: a tool for drafting, curating, and analyzing pan and multi-strain genome-scale metabolic models journals.asm.org/doi/full/10.... #jcampubs

💾 Prokka 1.15.6 is released! This is the last major release of Prokka. But don't be sad, because @oschwengers.bsky.social already has an excellent replacement called Bakta you can migrate to. #bioinformatics #microbiology #genomics github.com/tseemann/pro...

Nous y étions et avons participé activement aux FROGSDays 2025 ✨, un rendez-vous marqué par le partage 🤝, l’innovation 🔬 et les échanges autour du métabarcoding microbien. Plus d'information : lnkd.in/d3A7qN4n

Trois jours d’échanges riches sur la structuration de la bioinformatique en France et les nombreux défis stratégique : IA, ouverture des données, accompagnement des communautés , gestion des donnes sensibles …

📣🚀✨Toutes nos équipes et plateformes sont réunies depuis hier pour cette nouvelle édition du All-Hands IFB/ELIXIR-FR 2025 ! #ElixirFR25

Migale est partie prenante des #FROGS Days (1-3/12/25), pour célébrer les 10 ans de l’outils #FROGS pour l’analyse de données de metabarcoding. @cmidoux.bsky.social @mahendram.bsky.social et Olivier Rué y présentent certaines de nos contributions. 👉 frogsdays.symposium.inrae.fr