Face au froid, l’inaction n’est pas une option. 📞 Un réflexe citoyen si vous voyez une personne en détresse : appelez le 115. #GrandFroid #CroixRouge #Solidarité #UrgenceSociale

« Ne prendre en charge les femmes enceintes que si elles sont dans leur huitième mois de grossesse et ne prendre en charge que les familles avec des enfants [de]moins de trois mois » Face a la pénurie l’indigence des critères d’attribution de places au 115. www.franceinfo.fr/societe/pauv...

Save the date: The Galaxy Training Academy 2026 will happen from May 18th to May 22th Read more at https://training.galaxyproject.org/training-material/news/2025/11/13/gta-date-2026.html @galaxyproject.bsky.social

A Paris, le nombre de sans-abri dans les campements au plus haut depuis six ans

« Les salariés du 115 ont le sentiment d’être en première ligne face à un système grippé de l’intérieur » En Seine Saint-Denis comme ailleurs. Tellement de demandes, si peu de places ….

Gempipe: a tool for drafting, curating, and analyzing pan and multi-strain genome-scale metabolic models journals.asm.org/doi/full/10.... #jcampubs

💾 Prokka 1.15.6 is released! This is the last major release of Prokka. But don't be sad, because @oschwengers.bsky.social already has an excellent replacement called Bakta you can migrate to. #bioinformatics #microbiology #genomics github.com/tseemann/pro...

Nous y étions et avons participé activement aux FROGSDays 2025 ✨, un rendez-vous marqué par le partage 🤝, l’innovation 🔬 et les échanges autour du métabarcoding microbien. Plus d'information : lnkd.in/d3A7qN4n

Trois jours d’échanges riches sur la structuration de la bioinformatique en France et les nombreux défis stratégique : IA, ouverture des données, accompagnement des communautés , gestion des donnes sensibles …

📣🚀✨Toutes nos équipes et plateformes sont réunies depuis hier pour cette nouvelle édition du All-Hands IFB/ELIXIR-FR 2025 ! #ElixirFR25

Migale est partie prenante des #FROGS Days (1-3/12/25), pour célébrer les 10 ans de l’outils #FROGS pour l’analyse de données de metabarcoding. @cmidoux.bsky.social @mahendram.bsky.social et Olivier Rué y présentent certaines de nos contributions. 👉 frogsdays.symposium.inrae.fr

We're excited to release metaTraits.embl.de! 🦠 Interactively explore 140+ 𝗺𝗶𝗰𝗿𝗼𝗯𝗶𝗮𝗹 𝗽𝗵𝗲𝗻𝗼𝘁𝘆𝗽𝗶𝗰 𝘁𝗿𝗮𝗶𝘁𝘀, harmonized & integrated from culture-derived collections 🔬 & genome-based predictions 🧬 for >2M MAGs & genomes. Publication at NAR: doi.org/10.1093/nar/... @narjournal.bsky.social #microsky 🧵 1/8

📢 Registration for the Nanopore Users Day 2026 is now OPEN! Registration is free but mandatory 🗓️ 10 March 2026 📍Institut Pasteur Paris Make sure to secure your spot, see you there! 👉 www.eventbrite.com/e/billets-na... @chcrestani.bsky.social @pasteur.fr @nanoporetech.com @nebiolabs.bsky.social

Le calendrier de l'Avent de SadServers. Advent of Sysadmin 2025, la version sysadmin de l'Advent of Code, avec des serveurs tristes. (P+Lu) 👉 sadservers.com/advent

📢🚀💻Le nouveau site internet de l’IFB/ELIXIR-FR est en ligne !!! Lancé début 2025, le projet de refonte/création du nouveau site internet de l’IFB/ELIXIR-FR atteint aujourd’hui l’une de ses étapes cruciales : sa publication ! www.ifb-elixir.fr

Campagne de dons 2026 de Framasoft, un objectif de 250 000 € pour soutenir l'usage numérique éthique de 2 millions de bénéficiaires. ❤️ Pour soutenir l'association 👉 soutenir.framasoft.o...

🎉 À VOS AGENDAS ! 📅 Du 30 juin au 3 juillet 2026 📍 à Strasbourg, France JOBIM 2026 revient pour sa 26ᵉ édition ! JOBIM est l’événement annuel qui réunit toute la communauté bioinformatique française, sous l’égide de la SFBI, en partenariat avec l’IFB et le GDR BIMMM.

Avec une com dans Nature des chercheurs ayant identifié les failles www.nature.com/articles/s41... La question de la sécurité doit être au coeur des developpements, y compris en bioinformatique. Au dela du cas d'ONT, cela pose la question des formations ciblées "devs scientifique"et des moyens.

Bioinformatics x cybersecurity: Christina Boucher and her colleague Sara Rampazzi uncovered a basic yet critical vulnerability in MinIONs through the MinKNOW software bioengineer.org/portable-gen...

Rosalind Franklin, la véritable pionnière de ces travaux sur la découverte de la structure en double hélice de l'ADN, est morte en 1958 sans avoir jamais été reconnue comme la scientifique à l'origine des résultats qui ont valu le Nobel à Watson. 💪

"nos projections sur les impacts environnementaux à venir sont avant toutes coincées dans le présent" " […]d’une IA qui se substitue à tous les usages numériques actuels, ne permettent pas d’imaginer ce que notre consommation d’énergie va devenir" danslesalgorithmes.net/2025/06/16/i...

It was a really nice week working on building MiCoReCa, a catalogue of resources (tools, workflows, etc) for microbiome research, and more importantly networking with the large @elixir-europe.org community. Thank you all! See next year!

✏ Les Crayons Solidaires reviennent le mercredi 3 décembre à Paris, au Ground Control de 18h à 22h. Le principe est simple : vous venez sur place, vous payez pour qu'on vous tire le portrait, et tout l'argent va aux Restos du Coeur. Il y a aussi plein d'originaux et de tirages à acheter. À bientôt !

📢👩‍💻✍️ Inscription - Ecole thématique en bioinformatique intégrative (ETBII) du 29/03 au 3/04/2026, organisée par l’IFB ! 🎯 Au programme : Combiner et analyser des données biologiques multi-omiques issues de différentes sources afin d’obtenir une compréhension globale des systèmes biologiques

@vloux.bsky.social présentait aujourd'hui l'entrepôt de données #Siduri devant le SAB et le COS du Grand Défi #Ferments_du_Futur 👏

Plus de 900 sans-abri sont morts en 2024 : «Une augmentation exponentielle année après année» Il s’agit majoritairement d’hommes (dans 82 % des cas), mais aussi, et de plus en plus, de femmes (13 %) et d’enfants.

🧠🥼🧬🧪🔬 Last year at @sfn.org I ran a workshop on "Opening the File Drawer" with Ben Kolber, Stacey Winham, Paul Sternberg, & Alex Freeman (@alexandrafreeman.bsky.social). We've shared the resources that we compiled for that workshop in this new paper. ❤️ @comm4rigor.bsky.social @ummni.bsky.social

Our MARTi @nanoporetech.com paper is now out in @genomeresearch.bsky.social after several years of development (particularly Ned Peel and Sam Martin). We'd love to hear from users about how you're using it, or suggestions for new features. @earlhaminst.bsky.social genome.cshlp.org/content/earl...

Les crises font se rendre compte de nos faiblesses et peuvent favoriser l'apparition de solutions. L'europe a un rôle certain (et urgent !) à jouer pour diminuer notre dépendance aux outils financés par les États-Unis.

La Python Software Foundation a retiré sa demande de financement de 1,5 million de dollars auprès de la NSF, bien que sa proposition ait été acceptée. Cette décision a été motivée par une clause interdisant la promotion de la diversité, l’équité et l’inclusion. 👉 pyfound.blogspot.com...

1/2 Want to become up to date with pangenomes and genome graphs and their history? Check out this fantastic review by @zbao.bsky.social! Complexity welcome: Pangenome graphs for comprehensive population genomics #pangenomes #plantscience #genomegraphs www.cambridge.org/core/journal...

Science, volcanoes, and the Galaxy community...what more could you ask for? 🌋🇫 In case you missed it! The Galaxy Community Conference (#GCC2026) lands in Clermont-Ferrand, France, June 22–24, 2026! CoFest follows from June 25–26. Learn more and sign up for emails: galaxyproject.org/events/gcc20...

Dans cet article qui vient de sortir dans NOV'AE, nous avons voulu répondre à la question "Le verre réutilisable au labo a-t-il un impact environnemental moindre que le plastique à usage unique ?", en utilisant une approche d'Analyse de Cycle de Vie. Avec M. de Paepe revue-novae.fr/article/view...

Happy to share that the paper describing Autocycler is now 100% up: doi.org/10.1093/bioi... (1/3)

📍Pour en savoir plus sur les stratégies numériques pour les CRB : outils, défis et perspectives d'avenir > consulter le programme du séminaire RARe 2025 avec les résumés et la présentation des intervenants. Participation en visioconférence sur inscription 👉 www.agrobrc-rare.org

✨ Résolument engagée dans la #scienceouverte, l' @univparissaclay.bsky.social lance, en 2026, ses presses universitaires en accès libre et gratuit. 📢L' #appel à candidature est ouvert pour son comité d'expertise scientifique. 🗓️ Date limite : 01/10/2025 En savoir plus : tinyurl.com/ms568zkn

New blog post – A quick look at Roche's SBX lh3.github.io/2025/09/11/a...

New blog post: In Google's new paper, "An AI system to help scientists write expert-level empirical software" an AI supposedly "invents" new methods in bioinformatics and infectious disease modeling & forecasting. doi.org/10.59350/ymj... 🧬🖥️🧪

🚨PLEASE SHARE! France Génomique and the National network GREEN-omics are pleased to inform you of their upcoming Symposium on Environmental and Agronomical Genomics! 📍Paris, France, Feb 18 to 20, 2026. ➡️ eags2026.sciencesconf.org ➡️ Registration and call for abstracts are now open!

One year after our initial preprint, we're excited to post a major update to Logan. At its heart, Logan is the assembly of 27 million samples (50 Pbp) using a 6-day cloud-compute peaking at 2.2M vCPUs. This compresses the SRA 140x compared to raw FASTQs. github.com/IndexThePlan...

Dégustation de boissons fermentées en Pologne. Classique Komboucha et plus local buza (boulgour, raisin). Les deux produits localement. #fermentsdufutur

3 August 1911 | A Frenchman, Jean Berthout, was born in Limoges. In #Auschwitz from 8 July 1942. No. 45230 He perished in the camp on 13 August 1942.

Visite du mémorial d’Auschwitz-Birkenau. Un moment d’émotions et de recueillement mémoriel vécu en famille, accompagné par une guide d’une exceptionnelle justesse.

Congratulations to Rayan Chiki, (Institut Pasteur) head of the “Sequence Bioinformatics” unit, for securing the ERC Proof of Concept 2025 for his project ENZYMINER! 👏 ‪@rayan.chiki.bsky.social #Bioinformatics

On a accueilli @ketrus.bsky.social et Marid du Chimérarium pour parler de leur projet de Jdr Papier Néo-Lutèce. Mais surtout on y a joué ! Un super moment pour un super projet, n'hésitez pas à regarder la vidéo mais aussi sur leur Gamefound (lien dans le message suivant) youtu.be/OKXWvg7Oono

Mer de Glace depuis le Signal Forbes 😰 1890 | 2013 | 2021 Et c'est bien pire maintenant (2025), car depuis 2021 on a connu les deux pires années de fonte de l'histoire (2022 et 2023) qui a elles seules ont fait fondre 10% de l'ensemble de la glace alpine... en 2 ans! 🔥🥵

Reportage dans le massif du Mont-Blanc : ceci était la Mer de Glace C'est la une de Libération ce vendredi

Distribution Patterns of rRNA Copy Number Repeats in Prokaryotic Genomes www.biorxiv.org/content/10.1... #jcampubs

👏 Ca y est, #JOBIM2025 est officiellement fini ! Au nom de toute l'équipe, merci pour votre participation, et pour toutes ces discussions scientifiques intenses et stimulantes. Merci aussi pour votre enthousiasme, votre bienveillance et tous ces rires échangés pendant la conférence. 1/2 ⤵️