A journey into mathematical modelling for the plasmid binning problem on assembly graphs A joint work with Mattia Sgrò, Gianluca Della Vedova, Paola Bonizzoni, Cédric Chauve, Aniket Mane and Kerian Thuillier I was glad to present it at Forgenom II www.youtube.com/watch?v=47uf...

Alia vous appelle à signer la pétition contre le projet de pseudo-enquête sur l’antisémitisme dans l’ESR www.ldh-france.org/le-projet-de...

🔴 Communiqué AFSP/AFS/OALA/ALIA du 25 novembre 2025 — Non à l’enquête sur l’antisémitisme à l’Université À lire et télécharger ici : www.afsp.info/communique-2... #ESR #libertéacadémique @afs-socio.bsky.social @liberte-academique.cpesr.fr @aefsuprecherche.bsky.social @franceuniversites.bsky.social

Constatant la fragilité de la liberté académique dans un contexte général de montée des extrêmes droites, Alia œuvrera pour obtenir de nouveaux droits et de nouveaux textes de loi qui la renforceront. liberte-academique.fr/annulation-d...

Tribune de Jean-François Bayart La France, ce pays où mieux vaut une messe pour Pétain qu’un colloque sur Gaza blogs.mediapart.fr/jean-francoi...

[ #VeilleESR #Parcoursup ] Il vient de se passer un truc extraordinaire : le gouvernement a atteint un de ses objectifs. Celui de baisser la part des néobachliers recevant une proposition dans Parcoursup. C'est sans doute une date historique, le début de démassification éducative, . 🧵

Personne n'est surpris mais cette tribune honteuse marque aussi le passage officiel de "Le wokisme est dangereux car il veut empêcher de faire de l'histoire" à "Faire de l'histoire, c'est dangereux car c'est wokiste".

Extension Next : des alertes sur 8 500 sites GenAI et contre les attaques par homographes

Sans réaction collective très forte de notre part contre cet abus de pouvoir spectaculaire, nous n'aurons bientôt plus d'autre choix que de plier bagage, nous taire ou collaborer. Un soutien massif à Henry Laurens ne suffit pas. Ce colloque doit se tenir. 🔽🔽🔽 blogs.mediapart.fr/pascal-maill...

Si vous êtes confronté·e à des textes de votre institution qui vous semblent contrevenir à la liberté académique, nous vous invitons à les porter à notre connaissance ou à nous interroger en écrivant à l’adresse suivante : [email protected] liberte-academique.fr/chartes-regl...

Concrètement, une désumérisation à l’œuvre: quand le CNRS abandonne un labo dynamique à Tours, @umr-citeres.bsky.social La motion combative de l'AG du labo #VeilleESR

Un document concis et clair du @hc-climat.bsky.social

« Entropie et combinatoire » 👨‍🏫 Le Pr Timothy Gowers, titulaire de la chaire Combinatoire, introduit son cours de l’année 2025-2026. ⏰ Jusqu’au lundi 17 novembre 2025 Voir la suite 👉 https://tinyurl.com/8crwtump #Préludes #Science #Mathématiques

“You can only critically assess the output of an AI chatbot if you have the skills to do so, and you don’t develop these skills by using AI. Before you can be critical of an AI summary, you have to learn to understand a text without having it summarized by an AI tool.” apache.be/2025/10/24/b...

ALIA lance une alerte sur les risques que fait peser sur la liberté académique et la production scientifique la multiplication des laboratoires soumis au statut de Zone à Régime Restrictif (ZRR). Elle prend la forme d’une lettre ouverte sur les ZRR. liberte-academique.fr/zones-a-regi...

Encore une fois, le procès de Pinar Selek est reporté par le tribunal d'Istanbul. Un acharnement judiciaire matérialisant une "accusation à perpétuité" à son encontre #ESR #libertéacademique

oooh le bien que ça fait d'installer cette extension anti-IA à mon navigateur web !

ALIA, l'OALA et @caalap.bsky.social s'associent dans un communiqué en soutien à Pinar Selek, alors que la 6ème audience de son 5ème procès se tiendra le 21 octobre à Istanbul liberte-academique.fr/il-faut-mett...

Be like the MIT

L’Association pour la Liberté Académique (ALIA) apporte son plein soutien à Mathias Rollot et propose des évolutions de la loi permettant de protéger universitaires et chercheurs des procédures « bâillon ». liberte-academique.fr/nouvelle-pro...

Le SNCS-FSU apporte son soutien à notre collègue Gabriel #Zucman dont le travail de recherche rigoureux en économie a été caricaturé et dénigré par Bernard Arnault Le SNCS-FSU dénonce plus largement les attaques contre les libertés académiques 👇 sncs.fr/2025/09/25/l... #ESR #VeilleESR

Incroyable tableau en arrivant dans ma salle de cours ce matin @normalesup.bsky.social 🤩

Fermeture des petites maternités, destruction des PMI, etc. Dix départements français n'ont PAS de maternité. 75 % des maternités ont disparu en France en 50 ans. Et pas non plus d'augmentation conséquente de moyens dans les grandes maternités. Pas de mots. www.sciencesetavenir.fr/sante/maladi...

New blog post! metaMDBG (@gaetanbenoit.bsky.social) and Myloasm (@jimshaw.bsky.social) have had recent releases, so I updated the benchmarks from the Autocycler paper: rrwick.github.io/2025/09/23/a... Both tools improved considerably! Time to update your conda environments 😄

Today is a national day of action in France. In the world of research and academia, attacks on the autonomy of researchers and teachers are one of the reasons for this mobilisation. The material conditions necessary to work ethically are becoming less and less guaranteed. #ESR

Call for presentations for the Undone Computer Science 2026 conference www.undonecs.org/2026/cfp.html

« En substituant des termes flous à des notions bien définies, tout en esquivant les causes profondes des problèmes ainsi que les solutions possibles, cette tribune participe en réalité au brouillage des libertés qu’elle prétend défendre. »

Communiqué de presse : financement de la recherche publique : la communauté scientifique alerte sur un système à bout de souffle. #veilleESR, @info.gouv.fr @agencerecherche.bsky.social @cnrs.fr @franceuniversites.bsky.social @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @enseignementsup-recherche.gouv.fr

Le 16 octobre, à 13 h, au tribunal de Bobigny, le CVUH, Natacha Coquery ( sa présidente du CVUH) et Michèle Riot-Sarcey seront jugé pour diffamation, attaquées par Jean-Marc Berlière et René Fiévet, co-auteurs d'un livre minimisant le rôle de Vichy dans la Shoah. cvuh.hypotheses.org/1851

L'industrie du tabac (et d'autres) auparavant élaboraient des listes de « scientifiques de renoms » qui puissent se rallier à leurs intérêts privés, en communiquant dans les médias et faire croire à une dispute scientifique quand bien même iels n'étaient pas des domaines en question.

From Italy, I support my French colleagues who are protesting against the destruction of the public education, research and university system, among many other legitimate social and environmental demands. We claim a humanistic responsibility.

👏 Congratulations to both of you @camillemrcht.bsky.social and @npmalfoy.bsky.social !

✨ L'association ALIA fait sa rentrée ! Rejoignez-nous ou continuez de nous soutenir, sinon de vous engager en adhérant pour cette nouvelle année universitaire 2025-2026 : ➡️ liberte-academique.fr/adherer

[ #VeilleESR #LRU ] Financement privé et éthique de la recherche et de l'enseignement supérieur Conférence-débat 30/09 Montpellier Si vous êtes dans le coin, n'hésitez pas à me faire signe :) framaforms.org/recherche-et...

🌎👩‍🔬 For 15+ years biology has accumulated petabytes (million gigabytes) of🧬DNA sequencing data🧬 from the far reaches of our planet.🦠🍄🌵 Logan now democratizes efficient access to the world’s most comprehensive genetics dataset. Free and open. doi.org/10.1101/2024...

Soutien à ses proches et aux collègues qui souhaitent exercer leur travail avec éthique et humanité. Nous ne devons lâcher rien : seul le soutien collectif aura raison de cette injustice.

[ #VeilleESR #Elections2027 ] « Un choc des savoirs pour l'enseignement supérieur et la formation » Renaissance (LREM) ouvre le bal des programmes #ESR pour 2027. Un programme clairement édu-sceptique et obscurantiste, prenant le parti de l'atrophie éducative. doc.parti.re/Conventions-...

Chucho Valdés était interviewé sur @fip.fr radio, en musique, toujours ! www.radiofrance.fr/fip/podcasts...

Academic freedom is both a right and a responsibility held by individual academics and academic communities. 🏛️ Read EUA's position paper on ‘How universities can protect and promote academic freedom’ buff.ly/hLG95CL #HigherEd #AcademicFreedom

Pascal Maillard sur les attaques de l’exécutif sur le Palais de la Découverte à Paris et la Loi Baptiste blogs.mediapart.fr/pascal-maill...

Comme d'autres collectifs et groupes institutionnels de chercheurs et chercheuses, ALIA s’inquiètent de la dérive de la labellisation ZRR (Zone à Régime Restrictif). c.f. * motion CNU maths : minifi.ca/vSadb * Pétition collectifs chercheurs de l'Inria comp.collectif-inria.fr

Le mal est fait : JM. Blanquer et F. Vidal avaient nourri la bête immonde. Tout le monde académique y passera si nous ne luttons pas frontalement contre les idées de l'extrême droite.

Wetransfer se donne l’autorisation d’entrainer des IA sur les contenus qu’elle héberge next.ink/brief_articl... "Des alternatives existent. Par exemple, Disroot ou Ethibox hébergent un service du même genre en utilisant le logiciel libre Lufi."

@cnrsecologie.bsky.social regrette profondément l'adoption de cette loi à la vision court-termiste & ses conséquences graves sur l’environnement, qui méprise santé & bien-être de la population & le rôle des espèces sauvages dans la prod. agricole. La communauté scientifique n'a pas été entendue.

Nouveau billet: deux brèves et deux analyses, sur le Palais de la Découverte (pétition à signer) et sur le projet de loi Baptiste (très destructeur, rendez-vous à la rentrée pour enrayer le processus de démolition de l’Université et de la recherche et rouvrir l’horizon.) rogueesr.fr/palais-de-la...

At @jobim2025.bsky.social next week? Check out Romane Libouban's poster (n°51) "Genome Annotation tooling in @galaxyproject.bsky.social : contributions of the #EuroScienceGateway project" 📆 Tuesday 5:30-6:30 PM Let's connect! Co-author : @abretaud.bsky.social

[ #VeilleESR #Réforme ] Projet de loi de modernisation et de régulation de l'enseignement supérieur du MESR « une transformation profonde du système d’enseignement supérieur public et privé, à travers une réforme substantielle de la régulation de ce secteur »

Plus de 40 sociétés savantes ont écrit au Ministre de l'Enseignement Supérieur et la Recherche pour demander la réouverture du Palais de la Découverte, lieu emblématique mêlant tradition scientifique et enjeux de la recherche actuelle et future. smf.emath.fr/actualites-s...

Les attaques de l’administration Trump contre la recherche climatique pourraient affecter les travaux des chercheurs français. Lire l'article ➡️ https://l.reporterre.net/BOQ