Ensimmäinen johtamani tutkimushanke, "Suolistomikrobiston kasviperäisten ruokien metabolian genomipohjainen mallintaminen" on saanut rahoituksen Sakari Alhopuron Säätiöltä! Suuret kiitokset tuesta! www.sakarialhopuronsaatio.fi/apurahat/myo...

I have been tempted, but luckily haven't really committed yet to trying full-on AI-assisted data analysis. Better safe than sorry! The current best approach might be to only consult LLMs when solving specific issues in your own code.

Our new paper on allergies and skin microbiomes is now out! Thanks for the informative video, @microbiologysociety.org !

Our new systematic review is now out! Briefly, temporal multi-omic data and analyses are crucially needed to improve our understanding of microbiomes. Also, often the omics layers are not analyzed in an integrative way, even while such methods exist. academic.oup.com/bib/article/...

www.nature.com/articles/s41... Our new paper on the risks and socio-demographic dimensions of antibiotic resistance in the human gut is now out in @natcomms.nature.com!

🚨#infogut2025 The 1st INFOGUT COST Action meeting is taking place at the University of Bologna! We’re thrilled to come together to discuss the latest advancements in *in vitro colon models* simulating gut microbiota-mediated interactions #COSTAction #GutMicrobiota #InVitroModels #MicrobiomeResearch

Kaipa se on nyt virallista, kun allekirjotin työsopparinki 😎 Aloitan toukokuun alusta yliopistonlehtorina Bioteknologian laitoksella Turun yliopistossa! Tulevat opetushommat on varmasti antoisia, mutta nyt voin aloittaa myös oman tutkimusryhmän perustamisen, jos rahoituksen tuulet on suotuisia 🤞

Päivystys alkakoon! www.helsinki.fi/fi/tutustu-m...

Vaikka tagit ei niin hyvin toimi bskyssä, niin: #MinäTutkin ihmisten suolisto- ja ihomikrobistojen vaikutuksia kroonisiin sairauksiin, kuten 2-tyypin diabetekseen ja allergioihin. Lisäksi kehitän ja sovellan mm. koneoppivia mallinnusmenetelmiä mikrobistodatassa.

Ohoh, seuraajia! Tarkoituksena keskustella lähinnä töistäni eli mikrobiologiasta suomeksi ja englanniksi. X (formerly known as Twitter) alkoi kovasti tökkiä omistajanvaihdoksen jälkeen. En lupaa olla julkaisematta sisältöä mm. pyöräilystä, musiikista, ympäristöstä, ja ehkä jopa politiikasta.